فهرست:
چکیده 1
فصل اول- پیشگفتار
1-1 مقدمه. 2
1-2 پیشینه. 3
1-3 اساس و مبنای عملکرد. 4
1-4 اولین ترکیب های ضد سرطان. 5
1-5 ترکیبات روتنیم با خواص ضد سرطان. 10
1-6 کمپلکس های روتنیم آرن دار با خواص ضد توموری و ضد تکثیر. 12
1-7 کمپلکس های روتنیم تک هسته ای arene حاوی –P یا لیگاندهای- N دهنده 13
1-8 برهمکنش با DNA :چه نقشی بر کاهش سمیت سلولی دارد؟. 16
1-9 کمپلکس های روتنیم آلی فلزی: قانون شکنی و یا گزارش بحث برانگیز ؟. 18
1-10فعالیت بیولوژیکی یون های روتنیم: قسمت های فعال و یا قسمت های بی اثر؟ 20
فصل دوم- شیمی محاسباتی
2-1 مقدمه. 23
2-2 معادله شرودینگر. 26
2-3 روشهای محاسباتی از اساس... 27
2-3-2 روشهای همبستگی تغییر. 31
2-3-3 روش برهمکنش پیکربندی . 32
2-3-4 روشهای همبستگی اختلال. 32
2-3-5 نظریه اختلال مولر –پلست (MP) 33
2-3-6 روش های پوسته باز 35
2-3-7 نظریه روتان - هال. 35
2-4 نظریه تابعیت چگالی (DFT) 36
2-5 روش نیمه تجربی.. 39
2-6 روش مکانیک مولکولی.. 41
2-7 مجموعه پایه. 42
2-7-1 کمترین مجموعه پایه: STO-3G.. 44
2-7-2 مجموعه پایه ظرفیت شاخهای.. 45
2-7-3 مجموعه پایه دارای توابع قطبی کننده 27
2-7-4 مجموعههای پایه دارای توابع نفوذی.. 47
3-6 نرم افزارهای مورد استفاده 48
فصل سوم- بحث و نتیجهگیری
3-1 تجزیه و تحلیل انرژتیک... 51
3-2 تجزیه و تحلیل اوربیتال های جبهه ای.. 51
3-2-1سیمای اوربیتال های مولکول. 52
3-3تجزیه و تحلیلی ساختار 53
3-4 بررسی طیف زیر قرمز. 54
3-5 بررسی طیف الکترونی.. 56
3-6 وابستگی دمایی ویژگی های گرماشیمیایی.. 57
3-7 تجزیه و تحلیل اوربیتال های پیوندی طبیعی.. 60
3-8 بارهای اتمی.. 61
3-9 فوق قطبش پذیری.. 62
کارهای آینده 65
مراجع 66
چکیده لاتین.. 71
منبع:
A. K. Renfrew, A. D. Phillips, A. E. Egger, C. G. Hartinger, S. S. Bosquain, A. A. Nazarov, B. K. Keppler, L. Gonsalvi, M. Peruzzini and P. J. Dyson, Organometallics, 2009, 28, 1165.
A. Schaefer, H. Horn, R. Ahlrichs, J.Chem.Phys, 97, (1992) ,2571.
Alberta Bergamoa and Gianni Sava, Ruthenium anticancer compounds: myths and realities of the emerging metal-based drugs, Dalton Transactions, 40, 2011, 7817–7823.A.E. Reed, F. Weinhold, J. Chem. Phys. 83 (1985) 1736–1740.
A. Dorcier,W. H. Ang, S. Bola˜no, L. Gonsalvi, L. Juillerat-Jeanneret, G. Laurenczy, M. Peruzzini, A. D. Phillips, F. Zanobini and P. J. Dyson, Organometallics, 2006, 25, 4090.
A. D. Kelman, M. J. Clarke, S. D. Edmonds and H. J. Peresie, J. Clin. Hematol. Oncol. 1977, 7, 274.
A. C. G. Hotze, S. E. Caspers, D. de Vos, H. Kooijman, A. L. Spek, A. Flamigni, M. Bacac, G. Sava, J. G. Haasnoot and J. Reedijk, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 2004, 9, 354.
A. H. Velders, H. Kooijman, A. L. Spek, J. G. Haasnoot, D. de Vos and J. Reedijk, Inorg. Chem., 2000, 39, 2966.
B.J.Wang, B.G.Johnson, R.J.Boyd, andL.A.Eriksson, J.phys.chem, 100, (1996) 6317.
B. Serli, E. Zangrando, T. Gianferrara, C. Scolaro, P. J. Dyson, A. Bergamo and E. Alessio, Eur. J. Inorg. Chem., 2005, 3423.
B. Dutta, C. Scolaro, R. Scopelliti, P. J. Dyson and K. Severin, Organometallics, 2008, 27, 1355.
C. S. K. Rajapakse, A. Mart´ınez, B. Naoulou, A. A. Jarzecki, L. Su´arez, C. Deregnaucourt, V. Sinou, J. Schr´
C. A. Vock, W. H. Ang, C. Scolaro, A. D. Phillips, L. Lagopoulos, L. Juillerat-Jeanneret, G. Sava, R. Scopelleti and P. J. Dyson, J. Med.Chem., 2007, 50, 2166.
C. Manzotti, G. Pratesi, E. Menta, R. D. Domenico, E. Cavaletti, H. H. Fiebig, L. R. Kelland, N. Farrell, D. Polizzi, R. Supino, G. Pezzoni and F. Zunino, Clin. Cancer Res., 2000, 6, 2626.
C. A. Vock, C. Scolaro, A. D. Phillips, R. Scopelleti, G. Sava and P. J. Dyson, J. Med. Chem., 2006, 49, 5552.
C. Scolaro, A. Bergamo, L. Brescacin, R. Delfino, M. Cocchietto, G. Laurenczy, T. J. Geldbach, G. Sava and P. J. Dyson, J. Med. Chem., 2005, 48, 4161.
C. S. Allardyce, P. J. Dyson, D. E. Ellis, P. A. Salter and R. Scopelliti, J. Organomet. Chem., 2003, 668, 35.
C. A. Vock, A. K. Renfrew, R. Scopelliti, L. Juillerat-Jeanneret and P. J. Dyson, Eur. J. Inorg. Chem., 2008, 1661.
C. Scolaro, T. J. Geldbach, S. Rochat, A. Dorcier, C. Gossens, A. Bergamo, M. Cocchietto, I. Tavernelli, G. Sava, U. Rothlisberger and P. J. Dyson, Organometallics, 2006, 25, 756.
D. Chatterjee, A. Mitra and G. S. De, Platinum Met. Rev., 2006, 50,
e.lewars,Computationalchemistry,Kluweracademicpublishers,boston,2003,pp.225-229
evel, E. Musi, G. Ambrosini,G. K. Schwartz andR.A. S´anchez-Delgado, Inorg. Chem., 2009, 48, 1122.
E. Alessio, G. Mestroni, G. Nardin, W. M. Attia, M. Calligaris, G. Sava and S. Zorzet, Inorg. Chem., 1988, 27, 4099.
F. Kratz, M. Hartmann, B. K.Keppler and L.Messori, J. Biol. Chem., 1994, 269, 2581.
F.Wang, H. Chen, J. A. Parkinson, P. d. S. Murdoch and P. J. Sadler, Inorg. Chem., 2002, 41, 4509.
F.Wang, J. Bella, J. A. Parkinson and P. J. Sadler, JBIC, J. Biol. Inorg. Chem., 2005, 10, 147.
F. Wang, H. Chen, S. Parsons, I. D. H. Oswald, J. E. Davidson andP. J. Sadler, Chem.–Eur. J., 2003, 9, 5810.
G. Sava, S. Pacor, S. Zorzet, E. Alessio and G. Mestroni, Pharmacol. Res., 1989, 21, 617.
Georg Suss-Fink, Arene ruthenium complexes as anticancer agents, Dalton Transactions, 39, 2010, 1673–1688.
H.-K. Liu, F. Wang, J. A. Perkinson, J. Bella and P. J. Sadler, Chem.– Eur. J., 2006, 12, 6151.
H. Chen, J. A. Parkinson, R. E. Morris and P. J. Sadler, J. Am. Chem. Soc., 2003, 125, 173.
H. Chen, J. A. Parkinson, S. Parsons, R. A. Coxall, R. O. Gould and P. J. Sadler, J. Am. Chem. Soc., 2002, 124, 3064.
H.Keller and B.Keppler, US Patent, 1989, 4843069; cf. B.K.Keppler, K.-G. Lipponer, B. Stenzel and F. Kratzin, in, B. K. Keppler (editor), Metal Complexes in Cancer Chemotherapy, VCH, Weinheim, 1993, p. 187.
I. Bratsos, S. Jedner, A. Bergamo, G. Sava, T. Gianferrara, E. Zangrando and Enzo Alessio, J. Inorg. Biochem. 2008, 102, 1120.
Ioannis Bratsos, a Elisa Mitri,a Francesco Ravalico,a Ennio Zangrando,a Teresa Gianferrara,a Alberta Bergamob and Enzo Alessio, New half sandwich Ru(II) coordination compounds for anticancer activity, Dalton Transactions, 41, 2012, 7358–7371.
J. R. Durig, J. Danneman, W. D. Behnke and E. E. Mercer, Chem.- Biol. Interact., 1976, 13, 287.
Jos´e Ruiz, a Consuelo Vicente,a Concepci´on de Haroa and Delia Bautistab, A novel ruthenium(II) arene based intercalator with potent anticancer activity, Dalton Transactions, 2009, 5071–5073.
L. Ronconi and P. J. Sadler, Coord. Chem. Rev., 2007, 251, 1633.
M. Melchart and P. J. Sadler, in, G. Jaouen (editor), Bioorganometallics,Wiley-VCH, Weinheim, 2006, p. 39.
M. J. Clarke, Met. Ions Biol. Syst., 1980, 11, 231.
M. Coluccia, G. Sava, F. Loseto, A. Nassi, A. Bocarelli, D. Giordano, E. Alessio and G. Mestroni, Eur. J. Cancer, 1993, 29, 1873.
M. J. Clarke, Coord. Chem. Rev., 2003, 236, 209.
M.-G. Mendoza-Ferri, C. G. Hartinger, R. E. Eichinger, N. Stolyarova, K. Severin,M. A. Jakupec, A. A. Nazarov and B. K. Keppler, Organometallics, 2008, 27, 2405.
M.-G.Mendoza-Ferri, C.G.Hartinger, A.A.Nazarov, W.Kandioller, K. Severin and B. K.Keppler, Appl. Organomet. Chem., 2008, 22, 326.
M. Auzias, B. Therrien, G. S¨uss-Fink, P. ˇStˇepniˇcka, W. H. Ang and P. J. Dyson, Inorg. Chem., 2008, 47, 578.
M. J. Clarke, F. Zhu and D. R. Frasca, Chem. Rev., 1999, 99, 2511.
M. S. Gordon, Chem. Phys. Lett., 76, (1980), 163.
M. J. F risch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A.; Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck,
A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision B.03; Gaussian, Inc., Pittsburgh PA,: 2003.
Markus Galanski , AfshinYasemi, Susanna Slaby, Michael A. Jakupec, Vladimir B. Arion, Monika Rausch, AlexeyA. Nazarov, Bernhard K. Keppler European Journal of Medicinal Chemistry, 39, (2004), 707–714.
M. Melchart, A. Habtemariam, O.Novakova, S. A. Moggach, F. P. A. Fabbiani, S. Parsons, V. Brabec and P. J. Sadler, Inorg. Chem., 2007,46, 8950.
O. Novakova, J. Kasparkova, O. Vrana, P. M. Vanvliet, J. Reedijk and V. Brabec, Biochemistry, 1995, 34, 12369.
O.Novakova, H.Chen, O.Vrana, A.Rodger, P. J. Sadler andV. Brabec, Biochemistry, 2003, 42, 11544.
P. M. Vanvliet, S. M. S. Toekimin, J. G. Haasnoot, J. Reedijk, O. Novakova, O. Vrana and V. Brabec, Inorg. Chim. Acta, 1995, 231, 57
P. C. Hariharan, J. A. Pople, Mol. Phys, 27, (1974), 209.
P. J. Hay, W. R. Wadt, J.Chem.Phys, 82, (1985), 299.
P. J. Hay, W. R. Wadt, J.Chem.Phys, 82, (1985) ,284.
P. J. Hay, W. R. Wadt, J.Chem.Phys, 82, (1985), 270.
P.Burk and K.Sillar,Theochem,535,49,(2001) ,225.
P. J. Dyson, Nature, 2009, 458, 389.
R.Vilaplana,M.Romero,M.Quiros, J. Salas andF. Gonzalez-Vilches, Met.-Based Drugs, 1995, 2, 211.
R. E. Aird, J. Cummings, A. A. Ritchie, M. Muir, R. E. Morris, H.Chen, P. J. Sadler and D. I. Jodrell, Br. J. Cancer, 2002, 86, 1652.
S. J. Dougan, A. Habtemariam, S. E. McHale, S. Parsons and P. J.Sadler, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2008, 105, 11628.
S. Kapitza, M. Pongratz, M. A. Jakupec, P. Heffeter, W. Berger, L. Lackinger and B. K. Keppler, J. Cancer Res. Clin. Oncol., 2005, 131,
T. Bugarcic, A. Habtemariam, J. Stepankova, P. Heringova, J. Kasparkova, R. J. Deeth, R. D. L. Johnstone, A. Prescimone, A. Parkin, S. Persons, V. Brabec and P. J. Sadler, Inorg. Chem., 2008, 47,11470
T. A. Hensing, N. H. Hanna, H. H. Gillenwater, M. G. Camboni, C. Allievi and M. A. Socinski, Anti-Cancer Drugs, 2006, 17, 697.
W. F. Schmid, R. O. John, V. B. Arion, M. A. Jakupec and B. K. Keppler, Organometallics, 2007, 26, 6643.
W. H. Ang, A. De Luca, C. Chapuis-Bernasconi, L. Jeuillerat- Jeanneret, M. Lo Bello and P. J. Dyson, ChemMedChem, 2007, 2,1799.
W. H. Ang, E. Daldini, C. Scolaro, R. Scopelliti, L. Juillerat-Jeanneret and P. J. Dyson, Inorg. Chem., 2006, 45, 9006.
W. H. Ang, Z. Grote, R. Scopelliti, L. Juillerat-Jeanneret and K. Severin, J. Organomet. Chem., 2009, 694, 968.
R. Ditchfield, W. J. Hehre, J. A. Pople, J. Chem. Phys ,54 ,(1971), 724.
W.o.george,b.f.jones,R.Lewis, and J.M.Price.struct., ,281(2000) 550-551.